1、 ICS 13.020.01 CCS Z01 团体标准 T/CSES 812023 淡水生物监测 环境 DNA 宏条形码法 Freshwater biomonitoringEnvironmental DNA metabarcoding method 发布稿 2023-01-04 发布 2023-01-04 实施 中国环境科学学会 发 布 T/CSES 812023 I 目次 前言.II 引言.III 1 范围.1 2 规范性引用文件.1 3 术语和定义.1 4 试剂.3 5 设备和材料.3 样品采集及前处理设备.3 实验室分析设备.3 分析软件.3 其他辅助设备和材料.3 6 环境 DNA 宏
2、条形码监测方法.4 环境 DNA 宏条形码监测流程.4 环境 DNA 样品采集.4 环境 DNA 提取.5 宏条形码扩增与测序.5 生物信息学分析.6 生物统计表.6 7 质量控制与质量保证.7 质量控制.7 质量保证.8 8 废弃物处理.8 附录 A(资料性)环境 DNA 固定剂.9 附录 B(资料性)环境 DNA 采样记录表.10 附录 C(资料性)分子分类单元累积曲线构建方法.11 附录 D(资料性)常用 DNA 条形码扩增引物信息.12 附录 E(资料性)分子实验记录表.13 附录 F(资料性)生物信息学分析记录表.15 附录 G(资料性)生物统计表.16 附录 H(规范性)野外质量保
3、证.17 附录 I(规范性)实验室质量保证.18 T/CSES 812023 II 前言 本文件按照GB/T 1.12020标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则的规定起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件由南京大学提出。本文件由中国环境科学学会归口。本文件起草单位:南京大学、江苏省环境监测中心、中国环境监测总站、中国环境科学研究院、昆明学院、南京易基诺环保科技有限公司。本文件主要起草人:张效伟、张咏、张丽娟、杨江华、金小伟、杨雅楠、王书平、吕学研、田颖、徐杉、赵峥、贾世琪、王志浩、孙晶莹。T/CSES 812023 III 引言
4、利用环境DNA开展生物监测和生物多样性调查是一个快速发展的领域。环境DNA宏条形码法是一种有效的淡水生物多样性调查方法,可以高效评估物种的存在与否和相对丰度。为规范淡水生物环境DNA宏条形码监测技术,促进该技术在我国生物多样性监测体系中的应用推广,制定本文件。T/CSES 812023 1 淡水生物监测 环境 DNA 宏条形码法 1 范围 本文件规定了利用环境DNA宏条形码技术监测淡水生物的方法和质量控制与质量保证。本文件适用于基于DNA序列相似性的淡水生物多类群监测,包括浮游植物、着生藻类、水生维管束植物、浮游动物、大型底栖无脊椎动物和鱼类等。2 规范性引用文件 下列文件中的内容通过文中的规
5、范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB 19489 实验室 生物安全通用要求 GB/T 30989 高通量基因测序技术规程 GB/T 35537 高通量基因测序结果评价要求 GB/T 35890 高通量测序数据序列格式规范 GB/T 40266 环境微生物宏基因组检测 高通量测序法 HJ 494 水质 采样技术指导 HJ 710.8 生物多样性观测技术导则 淡水底栖大型无脊椎动物 SC/T 9402 淡水浮游生物调查技术规范 SN/T 4278 国境口岸医学媒介昆虫DNA条
6、形码鉴定操作规程 SN/T 4835 实验室生物废弃物管理要求 DB 32/T 4178 河流水生态监测规范 3 术语和定义 GB/T 30989和SN/T 4278界定的以及下列术语和定义适用于本文件。高通量测序 high-throughput sequencing 区别于传统Sanger(双脱氧链末端终止法)测序,能够一次并行对大量核酸分子进行平行序列测定的技术。来源:GB/T 309892014,3.19,有修改 环境 DNA environmental DNA;eDNA 环境介质(水、土壤、沉积物、生物膜、空气等)或混合生物组织中存在的生物遗传物质(DNA)。DNA 条形码 DNA barcode 生物体细胞核或者细胞器中能够代表该物种的标准的、有足够变异的、易扩增的短DNA序列,可用于生物的识别和鉴定。来源:SN/T 42782015,3.1,有修改 16S 核糖体 DNA 16S ribosomal DNA;16S rDNA 原核生物核基因组上编码核糖体小亚基16S rRNA的DNA序列。18S 核糖体 DNA 18S ribosomal DNA;18S rDNA 真核生物
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