1、基于环境DNA的长江水生生物监测与完整性评价技术导则TCQSES 27-2025讲解了利用环境DNA（eDNA）技术对长江流域水生生物进行系统性监测与生物完整性评估的技术路径与标准化操作流程。该文件明确了适用于长江鱼类、大型底栖无脊椎动物、浮游动物及重点保护物种（如中华鲟、长江江豚）的监测方法，涵盖了从采样布点、样本采集、DNA提取、基因扩增、高通量测序到生物信息学分析的全过程技术要求。导则提出了科学合理的监测点位设置原则，强调避开非代表性区域如排污口和死水区，并根据水体宽度和深度规范垂线与采样点布设方式。在采样环节，规定了水体、表层沉积物等不同介质的采集与保存条件，尤其强调现场过滤或低温保存
2、以保障eDNA完整性。文件还引入索引（Index）和操作分类单元（OTU）等分子生物学概念，确保多样本混检后的数据可追溯性和物种识别准确性。完整性评价部分构建了以生物群落结构、多样性水平和功能组织为核心的评价体系，参考自然生境状态下的期望值进行比对分析。附录中提供了长江重点水体名单、监测位点清单以及关键保护物种的条形码引物序列，增强了技术方案的可操作性与针对性。整个技术流程融合了现代分子生物学与生态学评价理念，推动传统水生生物监测向高效、精准、非侵入式方向转型升级。基于环境DNA的长江水生生物监测与完整性评价技术导则TCQSES 27-2025适用于从事水生态环境监测、水生态健康评估及相关科研管理工作的机构与人员，尤其适用于生态环境主管部门、水利水务单位、环境监测站、科研院所及第三方环境检测服务机构。该导则可广泛应用于长江流域的河流、湖泊、水库等水体的生物多样性调查、水生态质量考核、重点保护物种分布监测以及重大工程生态影响评估等领域。同时，由于其技术框架具有较强的通用性和可复制性，也可为其他流域开展基于环境DNA的水生生物监测提供参考依据，特别适合在难以实施传统捕捞式调查的敏感水域、保护区或复杂水文条件下推广应用，是支撑生态文明建设、实现长江大保护战略的重要技术工具。
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