基于高通量测序的农作物基因分型检测技术规程DB43T3250-2025.pdf

1、基于高通量测序的农作物基因分型检测技术规程DB43T3250-2025讲解了面向湖南省农业实践需求所制定的、具有可操作性和区域适配性的农作物基因分型标准化作业流程。该规程系统规定了从样本采集到基因分型结果输出全过程的技术要求，涵盖叶片与种子两类主要农作物样本的规范化取样、保存及运输方式，明确了DNA提取（包括CTAB磁珠法和离心柱法）的操作细节与适用条件，并对DNA完整性、浓度及纯度等质控指标提出了依据国家标准的判定标准。规程详细描述了高通量测序环节中联合探针锚定测序法（PAS）与边合成边测序法（SBS）两类主流建库测序路径的操作步骤、反应条件与质量阈值，进一步界定了测序原始数据的质控策略（含

2、FASTQ格式检查、接头去除、低质量碱基过滤）及下游基因分型分析的核心算法逻辑与结果验证方法。附录提供了DNA电泳图谱判读指南与FASTQ文件结构示例，增强一线技术人员对关键质控节点的识别能力。整个规程强调实验可重复性、数据可追溯性及生物安全合规性，突出对水、试剂、耗材、仪器运行环境等支撑要素的标准化约束，体现对GB/T系列国家基础标准的有机整合与本地化延伸。基于高通量测序的农作物基因分型检测技术规程DB43T3250-2025适用于从事农作物种质资源鉴定、分子标记辅助育种、品种真实性与纯度检测、转基因成分筛查及区域良种繁育管理的技术人员与机构，具体包括省级及地市级农科院所、种业企业研发实验室、第三方检测认证机构、高校生命科学与农学相关教学科研单位，以及承担农业农村部门委托检测任务的资质实验室。规程亦适用于参与农作物新品种审定、登记、保护及市场监管中需开展分子水平验证工作的行政支撑单位和技术审查专家。对于采用高通量测序平台开展作物遗传研究的科研团队、生物信息分析工程师及质量管理体系内审员，本规程可作为方法学验证、SOP编制与CNAS认可准备的重要技术依据。其技术参数与流程设计兼顾湖南主栽作物（如水稻、油菜、柑橘、辣椒等）的生物学特性及当地温湿度环境特征，对中南地区同类农业生物技术应用场景具有较强参考价值。